More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19440  rRNA methylase, putative, group 3  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000129696 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2398  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  65.45 
 
 
248 aa  343  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.670056 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03790  rRNA methylase, putative, group 3  59.45 
 
 
300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000601463  normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1180  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.63 
 
 
338 aa  261  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000228447  hitchhiker  0.0000274792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.87 
 
 
246 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  38.84 
 
 
244 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  39.51 
 
 
289 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  39.51 
 
 
289 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.5 
 
 
246 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  41.06 
 
 
243 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  38.93 
 
 
277 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.75 
 
 
245 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  39.59 
 
 
247 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.45 
 
 
234 aa  175  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.35 
 
 
327 aa  175  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.82 
 
 
255 aa  175  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.78 
 
 
247 aa  174  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.37 
 
 
247 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  38.37 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  38.37 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  38.37 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  38.37 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.37 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.37 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  38.37 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  41.25 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.89 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  40.64 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.55 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.4 
 
 
324 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.55 
 
 
322 aa  171  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.3 
 
 
239 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  37.55 
 
 
247 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.77 
 
 
247 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  37.96 
 
 
322 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  37.55 
 
 
246 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.48 
 
 
292 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.48 
 
 
292 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.11 
 
 
248 aa  168  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  39.27 
 
 
252 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  35.6 
 
 
323 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.14 
 
 
321 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.3 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.52 
 
 
249 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  37.7 
 
 
248 aa  165  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.7 
 
 
246 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  37.7 
 
 
248 aa  165  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.8 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  38.68 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.73 
 
 
306 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.52 
 
 
316 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  35.25 
 
 
288 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  38.17 
 
 
314 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.7 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  37.8 
 
 
372 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  38.11 
 
 
242 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.36 
 
 
251 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  34.96 
 
 
256 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  34.02 
 
 
249 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.39 
 
 
252 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  38.78 
 
 
323 aa  159  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.02 
 
 
327 aa  158  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  36.99 
 
 
373 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.85 
 
 
320 aa  158  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.45 
 
 
248 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.3 
 
 
246 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  37.76 
 
 
250 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  35.54 
 
 
249 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.21 
 
 
254 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.43 
 
 
237 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.44 
 
 
324 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158472  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.34 
 
 
326 aa  156  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.25 
 
 
246 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  36.51 
 
 
312 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.71 
 
 
250 aa  155  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.54 
 
 
253 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0372  RNA methyltransferase  37.76 
 
 
386 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176167  hitchhiker  0.00238073 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  35.2 
 
 
248 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  36.89 
 
 
314 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0781  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.37 
 
 
324 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208015  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.91 
 
 
247 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  37.55 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0753  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.33 
 
 
246 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205206  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.92 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  37.65 
 
 
249 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.01 
 
 
387 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  35.06 
 
 
330 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  37.65 
 
 
249 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  35.92 
 
 
242 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3288  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.73 
 
 
246 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0363  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.6 
 
 
244 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  35.77 
 
 
248 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  37.04 
 
 
248 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  37.04 
 
 
248 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.3 
 
 
261 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.33 
 
 
246 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.6 
 
 
519 aa  149  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.1 
 
 
246 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0581  RNA methyltransferase  40.55 
 
 
246 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61599  hitchhiker  0.0000000000000171085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>