23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12380 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  30.77 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  29.25 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  30.45 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  31.27 
 
 		 284 aa  99  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  27.31 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  41.32 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  27.89 
 
 		 602 aa  87.4  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  26.86 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  27.41 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  38.39 
 
 		 540 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.59 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  35.34 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  28.46 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  27.31 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  37.11 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  25.64 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  24.9 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  25.98 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  47.83 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  24.42 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  45.16 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  40 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>