More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3353 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
312 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
310 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
307 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
312 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
323 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
331 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  28.76 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  30 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  27.92 
 
 
1065 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
322 aa  79  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  28.51 
 
 
1041 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
785 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
924 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.43 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.43 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  28.43 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  28.43 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.94 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
528 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.66 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.45 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  33.06 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3187  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0795878  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
460 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  27.08 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
623 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
466 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  24.02 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  27.6 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  34.17 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  26.98 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  30.3 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.69 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  28.14 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
394 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  33.91 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  39.36 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  25.32 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.19 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>