More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3106 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  761    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  68.01 
 
 		 370 aa  501  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  59.28 
 
 		 376 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  59 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  56.72 
 
 		 370 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  54.29 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  53.39 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  54.05 
 
 		 374 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  54.14 
 
 		 373 aa  394  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  50.81 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  53.23 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  55.38 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  51.36 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  51.09 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  52.76 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  54.14 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  54.57 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  53.31 
 
 		 372 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  51.36 
 
 		 371 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  51.09 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  50.55 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  51.21 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  52.14 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  51.61 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  52.78 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  51.93 
 
 		 371 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  51.93 
 
 		 371 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  51.93 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  50.94 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  50.94 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  50.94 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  50.94 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  50.67 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  52.91 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  50.94 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  50 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  50.94 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  50.83 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  51.08 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  50.94 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  52.91 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  51.21 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  48.79 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  52.86 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  50 
 
 		 371 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  50.67 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  50.4 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  52.15 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  52.63 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  52.86 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  52.86 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  49.87 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  51.77 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  53.48 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  52.42 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  49.6 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  49.6 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  49.72 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  49.6 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  51.08 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  49.33 
 
 		 377 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  49.33 
 
 		 377 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  49.33 
 
 		 377 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  49.33 
 
 		 377 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  49.33 
 
 		 377 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  49.33 
 
 		 377 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  52.04 
 
 		 378 aa  364  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  50.98 
 
 		 372 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  49.33 
 
 		 377 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  48.79 
 
 		 377 aa  362  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  53.87 
 
 		 371 aa  362  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  52.04 
 
 		 371 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  49.06 
 
 		 377 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  52.92 
 
 		 371 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4159  alanine dehydrogenase  54.4 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5339  alanine dehydrogenase  53.59 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  47.68 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 		 365 aa  358  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  47.97 
 
 		 371 aa  358  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  48.48 
 
 		 371 aa  358  8e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  50.83 
 
 		 371 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  54.44 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  48.23 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  48.23 
 
 		 371 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  48.23 
 
 		 371 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  49.6 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  51.61 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  51.08 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 		 372 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  48.5 
 
 		 371 aa  354  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  51.34 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  48.06 
 
 		 370 aa  353  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  52.41 
 
 		 373 aa  352  5e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2381  alanine dehydrogenase  53.46 
 
 		 370 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0319294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  51.93 
 
 		 374 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0961  L-alanine dehydrogenase  50.42 
 
 		 373 aa  352  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  48.75 
 
 		 363 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  48.75 
 
 		 363 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  50.42 
 
 		 373 aa  352  8e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>