More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1825 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  100 
 
 		 326 aa  663    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  43.93 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  43.93 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  43.79 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  41.18 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  44.38 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  41.07 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  42.19 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  44.37 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  43.81 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  47.74 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  44.23 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  44.3 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  39.87 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  40.91 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  40.06 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  39.3 
 
 		 319 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  42.91 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  40.81 
 
 		 328 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  39.81 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  40.51 
 
 		 324 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  40 
 
 		 321 aa  232  8.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  35.24 
 
 		 338 aa  225  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  36.77 
 
 		 321 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  34.28 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  41.69 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  33.96 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  42.96 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  42.62 
 
 		 361 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  36.6 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  39.31 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  35.6 
 
 		 332 aa  219  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  36.6 
 
 		 332 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  36.6 
 
 		 332 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  36.27 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  43.21 
 
 		 361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  42.86 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  35.95 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  35.95 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  35.95 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  35.95 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  35.95 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  35.95 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  41.9 
 
 		 411 aa  215  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  36.81 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  38.78 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  37.42 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  37.05 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  37.38 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  35.05 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  35.79 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  39.46 
 
 		 388 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  37.46 
 
 		 364 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  39.36 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  34.18 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  39.56 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  39.02 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  39.05 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  36.93 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  34.91 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  32.91 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  32.91 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  38.19 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  34.49 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  39.02 
 
 		 333 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  34.85 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  36.94 
 
 		 350 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  35.53 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  36.75 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  37.37 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  36.75 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  39.34 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  33.53 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  37.37 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  37.37 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  34.15 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  37.37 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  37.37 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  37.37 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  37.04 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  36.65 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  35.26 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  36.54 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  37.25 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0319  biotin synthase  37.82 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225916  normal  0.0136703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  37.58 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  36.68 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  33.85 
 
 		 368 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  35.13 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  34.12 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2518  biotin synthase  38.33 
 
 		 354 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  35.69 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  35.69 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0897  biotin synthase  36.61 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  36.91 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  33.02 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  37.04 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  35.71 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  35.27 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  35.96 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>