More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1771 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 410 aa  833    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1564  tryptophan synthase subunit beta  70.39 
 
 		 406 aa  552  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  68.46 
 
 		 409 aa  546  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 		 403 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  68.38 
 
 		 396 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  67.69 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  66.23 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  65.81 
 
 		 397 aa  534  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  67.61 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  67.01 
 
 		 402 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 		 406 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 391 aa  532  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  65.55 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  65.55 
 
 		 407 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  65.97 
 
 		 402 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  65.46 
 
 		 403 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  65.76 
 
 		 410 aa  530  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  63.41 
 
 		 409 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  65.46 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  63.16 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  64.42 
 
 		 411 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  63.71 
 
 		 403 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  65.21 
 
 		 400 aa  518  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  63.66 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  63.66 
 
 		 397 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  66.49 
 
 		 409 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  65.45 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  64.87 
 
 		 398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  65.03 
 
 		 407 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 405 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  63.85 
 
 		 399 aa  511  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 408 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  64.14 
 
 		 406 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 399 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 399 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 405 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  64.06 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  62.86 
 
 		 405 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  63.85 
 
 		 402 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  64.92 
 
 		 406 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  63.03 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 414 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  63.28 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  65.1 
 
 		 405 aa  504  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.14 
 
 		 409 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4868  tryptophan synthase subunit beta  63.68 
 
 		 421 aa  501  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  63.54 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  62.96 
 
 		 413 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  64.43 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  64.54 
 
 		 401 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  65.25 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  61.92 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 410 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  61.92 
 
 		 413 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  63.31 
 
 		 418 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  64.77 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>