254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1214 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  290  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  46.62 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  47.97 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  47.97 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  47.97 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  44.9 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  41.22 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  45.99 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  44.22 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  43.54 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  43.66 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  39.19 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  41.1 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  39.46 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  40.82 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  39.31 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  40.41 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  39.73 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  37.84 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  41.5 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  40.82 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  40.41 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  39.73 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  43.26 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  41.13 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  40.82 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  40.54 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  40.82 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  41.1 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  43.05 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  38.78 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  39.73 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  38.51 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  38.51 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  43.42 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  38.51 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  37.5 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  36.49 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  36.49 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  36.05 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  43.54 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  40.13 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  37.91 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  41.13 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  37.67 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  40 
 
 		 178 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  37.67 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  37.67 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  43.57 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  40.15 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  39.01 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  37.06 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  36.91 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  36.91 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  39.46 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  36.88 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  35.53 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  38.3 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  38.26 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  40.3 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  38.3 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  38.81 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  38.64 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  41.89 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  35.53 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  34.46 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  36.23 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  39.19 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  37.86 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  37.67 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  35.92 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  35.92 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  35.92 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  35.92 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  35.92 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  35.92 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  34.46 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  38.78 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  36.18 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  35.92 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  47.78 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  37.16 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 		 148 aa  93.6  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  35.92 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  39.86 
 
 		 513 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  35.92 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>