More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1152 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1152  methyltransferase GidB  100 
 
 		 498 aa  1015    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181077  normal  0.598174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0404  methyltransferase GidB  60.21 
 
 		 490 aa  580  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0515  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.96 
 
 		 256 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.798322  normal  0.491435 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  30.28 
 
 		 238 aa  99  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  33.51 
 
 		 240 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  30.22 
 
 		 239 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.8 
 
 		 254 aa  93.6  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  29.38 
 
 		 242 aa  93.6  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 239 aa  93.2  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  34.39 
 
 		 231 aa  92.8  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 214 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  29.13 
 
 		 240 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 237 aa  89  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  31.21 
 
 		 212 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  31.07 
 
 		 207 aa  88.6  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  28.24 
 
 		 256 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  30.58 
 
 		 207 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  30.58 
 
 		 207 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  30.58 
 
 		 207 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  30.58 
 
 		 207 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  30.58 
 
 		 207 aa  87.4  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  30.58 
 
 		 207 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  30.58 
 
 		 207 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  32.39 
 
 		 240 aa  87  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  31.46 
 
 		 217 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 207 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  32.86 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  28.18 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2601  methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  28.18 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  27.75 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  28.83 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.9 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  27.31 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  30.9 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  32.49 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  28.64 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  27.95 
 
 		 239 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  31.32 
 
 		 239 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  28.19 
 
 		 242 aa  83.2  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  30.85 
 
 		 211 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  40.83 
 
 		 234 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  29.73 
 
 		 240 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  29 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  29.67 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  27.73 
 
 		 239 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  30 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  27.73 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  29.78 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  27.27 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  37.61 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  30.35 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  29.47 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  30.62 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  28.08 
 
 		 219 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  31.55 
 
 		 216 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  38.33 
 
 		 234 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2169  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.15 
 
 		 261 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000507695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  31.11 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  31.55 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  29.46 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  26.92 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  28.11 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2208  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.39 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  29.94 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  28.64 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  32.51 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  27.64 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  28.36 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  28.64 
 
 		 207 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 206 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  28.64 
 
 		 207 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.55 
 
 		 216 aa  76.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2835  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.04 
 
 		 277 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  28.64 
 
 		 207 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  34.59 
 
 		 212 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  28.64 
 
 		 207 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 206 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 206 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  28.31 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  28.64 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  28.96 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  31.16 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  35 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2063  putative rRNA methylase  29.58 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00825348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  26.34 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.72 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  29.25 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  27.03 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>