35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0963 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  100 
 
 		 460 aa  932    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  33.5 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  34.58 
 
 		 440 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  28.09 
 
 		 433 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 433 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  29.48 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  26.9 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  29.33 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  32.24 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  27.48 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  25 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  23.35 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  24.33 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  24.43 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  22.45 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  25.3 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  27.39 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 313 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  26.19 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  25.81 
 
 		 451 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  24.32 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  27.69 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  24.94 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  23.88 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  26.71 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  22.47 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  28.85 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  28.68 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  23.39 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  27.93 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  31.65 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  27.93 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>