82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3907 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3907  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0101  paraquat-inducible protein A  53.76 
 
 		 219 aa  200  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0138  paraquat-inducible protein A  47.89 
 
 		 222 aa  186  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3860  paraquat-inducible protein A  48.86 
 
 		 211 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4068  hypothetical protein  48.86 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0097  paraquat-inducible protein A  50 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4443  paraquat-inducible protein A  50 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3953  paraquat-inducible protein A  48.86 
 
 		 211 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4248  Paraquat-inducible protein A  50 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4303  paraquat-inducible protein A  50 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3870  paraquat-inducible protein A  48.86 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4710  hypothetical protein  47.73 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3492  paraquat-inducible protein A  41.67 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0283  hypothetical protein  46.29 
 
 		 202 aa  147  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  32.61 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  33.75 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  34.55 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  34.86 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  36.25 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  33.33 
 
 		 450 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  28.21 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  33.33 
 
 		 450 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  33.33 
 
 		 415 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  35.63 
 
 		 408 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  32.74 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  30.95 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1994  paraquat-inducible protein A  33.08 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.338034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  32.05 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  30.58 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  29.63 
 
 		 380 aa  44.7  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1580  paraquat-inducible protein A  30.95 
 
 		 209 aa  44.7  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.230902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  32.91 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  29.37 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  29.76 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  32.95 
 
 		 252 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  30.16 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  30.16 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  35.37 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  30.16 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  26.14 
 
 		 449 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  31.25 
 
 		 489 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1930  paraquat-inducible protein A  28.8 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  30.38 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  24.8 
 
 		 423 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  30.38 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  30.38 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  30.38 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  32.91 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  30.38 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  29.11 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  31.65 
 
 		 211 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  27.78 
 
 		 205 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  31.65 
 
 		 211 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  31.63 
 
 		 216 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  31.71 
 
 		 426 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  27.78 
 
 		 205 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  29.57 
 
 		 449 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  31.71 
 
 		 426 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  31.65 
 
 		 211 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  27.78 
 
 		 205 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  32.5 
 
 		 444 aa  41.6  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  32.05 
 
 		 247 aa  42  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 419 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  31.65 
 
 		 209 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  33.33 
 
 		 412 aa  41.2  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  31.65 
 
 		 209 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  32.14 
 
 		 427 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  34.57 
 
 		 427 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  34.57 
 
 		 427 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  34.57 
 
 		 427 aa  41.2  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  41.27 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  34.57 
 
 		 427 aa  40.8  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  41.27 
 
 		 207 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  34.57 
 
 		 427 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  34.57 
 
 		 427 aa  40.8  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  35 
 
 		 402 aa  41.2  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  34.57 
 
 		 427 aa  41.2  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>