More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3500 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  79.57 
 
 		 602 aa  1026    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  75.04 
 
 		 606 aa  962    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  55.12 
 
 		 611 aa  687    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  80.4 
 
 		 602 aa  1041    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  79.73 
 
 		 602 aa  1028    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  75.42 
 
 		 609 aa  975    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  79.26 
 
 		 600 aa  1007    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  53.97 
 
 		 616 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  80.56 
 
 		 602 aa  1040    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  80.73 
 
 		 602 aa  1043    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 610 aa  1271    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  80.9 
 
 		 602 aa  1045    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  74.87 
 
 		 606 aa  957    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  53.8 
 
 		 613 aa  686    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  75.67 
 
 		 623 aa  968    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  79.57 
 
 		 602 aa  1025    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  79.4 
 
 		 602 aa  1024    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  77.5 
 
 		 611 aa  992    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  79.4 
 
 		 602 aa  1020    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  49.92 
 
 		 624 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  33.78 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.6 
 
 		 662 aa  80.9  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.15 
 
 		 621 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  28.7 
 
 		 604 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  25.39 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.65 
 
 		 692 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 752 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  29.91 
 
 		 762 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 		 774 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6388  serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  25.29 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.08 
 
 		 907 aa  67.4  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  28.74 
 
 		 427 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  25.33 
 
 		 614 aa  66.6  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  26.13 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  24.91 
 
 		 781 aa  65.1  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.31 
 
 		 1797 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  25.57 
 
 		 1415 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 777 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1274  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 		 866 aa  64.3  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  24.66 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 		 985 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 562 aa  63.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.95 
 
 		 1072 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.95 
 
 		 1072 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 		 414 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  27.48 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.87 
 
 		 1795 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1121  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 		 719 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.612323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6426  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 		 465 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 466 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  24.47 
 
 		 642 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  29.59 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0235  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 415 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  28.37 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3751  serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000729349  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  25.09 
 
 		 620 aa  62  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 		 585 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  23.85 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 		 600 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  27.31 
 
 		 1100 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  28.57 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  28.87 
 
 		 1774 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6223  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.39 
 
 		 994 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.77 
 
 		 662 aa  61.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  25.53 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2673  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0573698  normal  0.794147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.26 
 
 		 636 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.52 
 
 		 627 aa  60.5  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 581 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.42 
 
 		 591 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 		 652 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.37 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 		 882 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.37 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.28 
 
 		 653 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  28.97 
 
 		 774 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 990 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2457  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  28.83 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 1122 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>