43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1504 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  100 
 
 		 111 aa  226  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2318  cytochrome c3  70 
 
 		 116 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2388  cytochrome c3  70 
 
 		 116 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.213014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2511  cytochrome c3  70.64 
 
 		 116 aa  167  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000190498  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1830  cytochrome c3  70.64 
 
 		 116 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.428734  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1786  cytochrome c3  70.64 
 
 		 116 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.790762  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1793  cytochrome c3  70.64 
 
 		 116 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2492  cytochrome c3  70.64 
 
 		 116 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2333  cytochrome c3  68.18 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.318001  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1871  cytochrome c3  66.67 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474787  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2727  cytochrome c3  65.45 
 
 		 116 aa  158  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1444  cytochrome c3  70.91 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000119366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1806  cytochrome c3  73.64 
 
 		 124 aa  146  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.021611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1724  cytochrome c3  70.91 
 
 		 116 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000750821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2769  cytochrome c3  69.37 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149845  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3964  hypothetical protein  46.39 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0244  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  39.6 
 
 		 596 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  39.6 
 
 		 596 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0515  hypothetical protein  39.18 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1825  cytochrome c3  40.86 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.870052  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  39.6 
 
 		 596 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  39.6 
 
 		 597 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  39.6 
 
 		 596 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35.59 
 
 		 593 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  38.79 
 
 		 596 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  40.59 
 
 		 596 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  40.59 
 
 		 596 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  40.59 
 
 		 596 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  40.59 
 
 		 596 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  39.22 
 
 		 596 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  39.22 
 
 		 596 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  41.76 
 
 		 583 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  42.34 
 
 		 596 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  34.62 
 
 		 589 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.91 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.58 
 
 		 589 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  26.79 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35.05 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  29.51 
 
 		 122 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.73 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  30.26 
 
 		 596 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  38.33 
 
 		 812 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>