263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3198 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  99.03 
 
 		 829 aa  1674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  42.24 
 
 		 822 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  99.16 
 
 		 829 aa  1674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.24 
 
 		 821 aa  646    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  41.43 
 
 		 834 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  99.03 
 
 		 829 aa  1669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  100 
 
 		 829 aa  1686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  99.28 
 
 		 829 aa  1674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  42.24 
 
 		 812 aa  647    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.55 
 
 		 832 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.64 
 
 		 832 aa  772    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  46.4 
 
 		 830 aa  768    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  41.14 
 
 		 833 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.35 
 
 		 828 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  39.42 
 
 		 816 aa  612  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  39.5 
 
 		 826 aa  598  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  40.26 
 
 		 833 aa  589  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  39.31 
 
 		 826 aa  591  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.31 
 
 		 826 aa  592  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  40.26 
 
 		 833 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  40.14 
 
 		 816 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  40.26 
 
 		 833 aa  588  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.17 
 
 		 846 aa  588  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.26 
 
 		 819 aa  588  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.26 
 
 		 818 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.21 
 
 		 835 aa  581  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.45 
 
 		 844 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  40.48 
 
 		 881 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  40.12 
 
 		 881 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  40.4 
 
 		 792 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  40.73 
 
 		 881 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.8 
 
 		 845 aa  568  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  40.12 
 
 		 881 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  37.25 
 
 		 885 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  37.25 
 
 		 885 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  37.25 
 
 		 885 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  37.37 
 
 		 885 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  37.46 
 
 		 882 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  37.92 
 
 		 860 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.46 
 
 		 881 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  37.71 
 
 		 880 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  37.44 
 
 		 881 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  37.66 
 
 		 881 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  37.59 
 
 		 880 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.17 
 
 		 829 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.41 
 
 		 828 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.53 
 
 		 828 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.53 
 
 		 828 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.2 
 
 		 817 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.29 
 
 		 828 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.53 
 
 		 828 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  36.35 
 
 		 813 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  36.47 
 
 		 813 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.35 
 
 		 813 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  36.35 
 
 		 813 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  38.38 
 
 		 579 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  31.24 
 
 		 820 aa  354  5e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  29.98 
 
 		 866 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  29.98 
 
 		 861 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.74 
 
 		 865 aa  324  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  30.05 
 
 		 866 aa  322  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.25 
 
 		 866 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.2 
 
 		 876 aa  311  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  30.06 
 
 		 888 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  28.22 
 
 		 866 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.43 
 
 		 837 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  29.55 
 
 		 839 aa  301  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.08 
 
 		 844 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  30.01 
 
 		 866 aa  301  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  29.34 
 
 		 871 aa  300  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  29.98 
 
 		 866 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  29.89 
 
 		 866 aa  298  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.98 
 
 		 866 aa  298  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  29.89 
 
 		 866 aa  298  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.4 
 
 		 833 aa  298  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  29.98 
 
 		 866 aa  297  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.46 
 
 		 840 aa  297  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  29.86 
 
 		 866 aa  297  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.52 
 
 		 877 aa  295  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  30.36 
 
 		 850 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  30.24 
 
 		 833 aa  294  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  29.07 
 
 		 840 aa  294  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  30.06 
 
 		 851 aa  293  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  30.74 
 
 		 838 aa  290  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.05 
 
 		 880 aa  290  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  30.74 
 
 		 863 aa  290  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  30.24 
 
 		 833 aa  290  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  30.44 
 
 		 838 aa  290  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.34 
 
 		 930 aa  290  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.74 
 
 		 838 aa  290  9e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  30.74 
 
 		 838 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  30.12 
 
 		 833 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  30.74 
 
 		 838 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  29.41 
 
 		 939 aa  289  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.74 
 
 		 838 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  29.55 
 
 		 870 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  29.23 
 
 		 870 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  29.66 
 
 		 863 aa  287  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  29.11 
 
 		 914 aa  287  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.16 
 
 		 852 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>