65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1609 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1609  hypothetical protein  100 
 
 
49 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  83.72 
 
 
325 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  85.37 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  83.72 
 
 
325 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  83.72 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  83.72 
 
 
325 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  83.72 
 
 
325 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  79.07 
 
 
325 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  80.95 
 
 
325 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  79.07 
 
 
293 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  73.81 
 
 
325 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  77.5 
 
 
325 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  85.71 
 
 
323 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  78.05 
 
 
325 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  71.43 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  71.43 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  72.09 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  71.43 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  69.05 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  64.71 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  69.05 
 
 
207 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  80 
 
 
325 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  75 
 
 
325 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  69.77 
 
 
325 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  69.77 
 
 
325 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  75 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  69.77 
 
 
325 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  69.77 
 
 
325 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  69.05 
 
 
325 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1728  hypothetical protein  69.77 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  81.08 
 
 
325 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  75 
 
 
325 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  75 
 
 
329 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  69.77 
 
 
326 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  69.77 
 
 
325 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  75 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  68.42 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  68.42 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  78.38 
 
 
325 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  72.97 
 
 
325 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  67.44 
 
 
325 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2256  hypothetical protein  83.33 
 
 
37 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0495  hypothetical protein  65.12 
 
 
56 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  72.97 
 
 
325 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  72.5 
 
 
319 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  75.68 
 
 
325 aa  67  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  72.97 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  65.79 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  78.95 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  70.27 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  70.27 
 
 
325 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  61.22 
 
 
326 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2257  hypothetical protein  85.19 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2034  hypothetical protein  82.14 
 
 
28 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2259  hypothetical protein  73.33 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  59.38 
 
 
326 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  54.05 
 
 
326 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  52.63 
 
 
325 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  74.07 
 
 
316 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  55.56 
 
 
326 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  52.63 
 
 
326 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  52.63 
 
 
326 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  58.06 
 
 
326 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  52.63 
 
 
326 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2174  hypothetical protein  70.37 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>