128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0052 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  100 
 
 
96 aa  191  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.44 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.86 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 
104 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.64 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.26 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  35.48 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  35.48 
 
 
104 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.19 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.79 
 
 
104 aa  57.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  35.16 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  31.96 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  34.07 
 
 
121 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  33.7 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.93 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  33.7 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  33.7 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.47 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  34.31 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  31.96 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  32.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  32.91 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.91 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.44 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.94 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  31.96 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  31.96 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.94 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.59 
 
 
106 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.83 
 
 
110 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
96 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.33 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.7 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.72 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  31.63 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.31 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.12 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.76 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.41 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  30.67 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  32.43 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.71 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.91 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.76 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.58 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.86 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  25.24 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  32.5 
 
 
109 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.68 
 
 
145 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
115 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  32.5 
 
 
109 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.35 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.12 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  24.27 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.14 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.14 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.72 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  33.8 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  29.27 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.51 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.09 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1116  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.17 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.84 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.94 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.86 
 
 
103 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  30.77 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  31.88 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.34 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.1 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  29.49 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  32.86 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.73 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>