132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2059 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  100 
 
 		 245 aa  500  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  55 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  54.74 
 
 		 233 aa  255  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  54.31 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  54.31 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  45.45 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  61.63 
 
 		 95 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 125 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  40.19 
 
 		 116 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 125 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  34 
 
 		 115 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  37.78 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  29.73 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  31.53 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  37.5 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 115 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  30.84 
 
 		 139 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  36.25 
 
 		 125 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 108 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  35.79 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  36.96 
 
 		 118 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 171 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  31.82 
 
 		 136 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  32.11 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  36.79 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  27.36 
 
 		 115 aa  62  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  29.67 
 
 		 114 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  33.68 
 
 		 114 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  29.67 
 
 		 114 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  35.87 
 
 		 118 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  29.41 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  31.4 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  32.53 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  33.7 
 
 		 111 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  29.67 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 137 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  30.39 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  30.39 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 129 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  33.72 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  29.63 
 
 		 121 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  33.77 
 
 		 125 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 115 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  31.71 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  36.99 
 
 		 112 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 118 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  32.22 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  26.25 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  26.25 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  34.04 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  31.11 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 109 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  32.58 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 107 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  32.58 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 138 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  29.52 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  32.58 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  33.71 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  29.52 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 117 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 120 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  32.35 
 
 		 111 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 162 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  27.17 
 
 		 368 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  27.17 
 
 		 368 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  27.78 
 
 		 368 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  26.21 
 
 		 114 aa  46.2  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  28.28 
 
 		 114 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  23.6 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>