47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1224 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 908 aa  1867    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  35.71 
 
 		 879 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 935 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 856 aa  334  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 867 aa  320  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  29.64 
 
 		 859 aa  287  7e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  28.52 
 
 		 862 aa  282  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  27.26 
 
 		 859 aa  280  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0447  TonB dependent receptor domain-containing protein  28.82 
 
 		 841 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000427237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2599  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 840 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 790 aa  213  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 790 aa  213  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 790 aa  211  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 790 aa  211  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 790 aa  211  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  26.77 
 
 		 790 aa  211  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 790 aa  211  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  26.77 
 
 		 790 aa  211  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 790 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 934 aa  178  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0894  hypothetical protein  26.24 
 
 		 488 aa  132  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 822 aa  54.7  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 1188 aa  53.5  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 844 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 		 804 aa  52.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 883 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  37.1 
 
 		 851 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 809 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  25.93 
 
 		 809 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 819 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 809 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 812 aa  47.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.46 
 
 		 1116 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  25.49 
 
 		 829 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27 
 
 		 1066 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 787 aa  46.6  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 843 aa  46.2  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.03 
 
 		 992 aa  46.2  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 973 aa  46.2  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  35.48 
 
 		 851 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 778 aa  45.8  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  30.91 
 
 		 813 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 807 aa  45.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 809 aa  45.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  21.88 
 
 		 821 aa  45.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 817 aa  44.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  22.44 
 
 		 884 aa  44.3  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>