More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0844 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0844  signal peptidase I  100 
 
 
276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0800  signal peptidase I  65.94 
 
 
286 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0582  signal peptidase I  59.93 
 
 
282 aa  346  2e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.359862  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1173  signal peptidase I  58.16 
 
 
285 aa  335  7e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.478468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  59.12 
 
 
282 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  56.01 
 
 
301 aa  330  1e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  58.39 
 
 
282 aa  329  3e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  57.3 
 
 
283 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1037  signal peptidase I  60.07 
 
 
278 aa  322  6e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1114  peptidase S26A, signal peptidase I  52.47 
 
 
269 aa  279  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.747736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  33.2 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  35.94 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  35.11 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.05 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  33.2 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  33.2 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  36.26 
 
 
268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  34.48 
 
 
270 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  33.46 
 
 
305 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  33.72 
 
 
251 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  34.85 
 
 
321 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  34.36 
 
 
262 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  33.33 
 
 
297 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.21 
 
 
297 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  33.33 
 
 
297 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  33.33 
 
 
297 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  33.98 
 
 
256 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  33.33 
 
 
297 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  33.33 
 
 
251 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  33.33 
 
 
297 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  33.33 
 
 
297 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  35.5 
 
 
268 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  34.84 
 
 
297 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  34.84 
 
 
297 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  33.74 
 
 
198 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  33.71 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  30.58 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  31.92 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  31.54 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  33.61 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  34.71 
 
 
305 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  32.81 
 
 
248 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  32.81 
 
 
248 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  33.2 
 
 
267 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  30.53 
 
 
216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  33.06 
 
 
268 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  35.96 
 
 
324 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  33.87 
 
 
305 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  35.96 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  35.96 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  35.96 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  33.07 
 
 
256 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  35.96 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  35.74 
 
 
305 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  35.74 
 
 
305 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  32.13 
 
 
288 aa  118  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  32.85 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  34.27 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  31.56 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  34.89 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  35.47 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.74 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  34.38 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  32.95 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  33.61 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  32.95 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  33.2 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  35 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  32.28 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  30.62 
 
 
200 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  32.03 
 
 
268 aa  116  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  32.58 
 
 
342 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  31.52 
 
 
221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  32.81 
 
 
284 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  33.2 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  34.47 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  34.47 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  34.47 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  33.2 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  34.47 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  32.81 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  35.85 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  28.32 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  30.91 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  32.93 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  33.2 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  33.2 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  32.42 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  33.2 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  32.52 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  32.58 
 
 
322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  33.2 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  32.81 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  33.2 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  33.2 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  33.05 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  33.75 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  33.2 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  33.72 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  35.09 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>