More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3911 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 446 aa  893    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  60.78 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  55.96 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  50.67 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  47.42 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  46.95 
 
 		 456 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  46.95 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  46.95 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  48.08 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  47.54 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  46.6 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  47.4 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  45.35 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  46.29 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  46.29 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  46.29 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  46.29 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  44.44 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  45.97 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  41.67 
 
 		 448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  41.44 
 
 		 448 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  41.44 
 
 		 448 aa  349  5e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  41.12 
 
 		 448 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  42.48 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  37.5 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  39.28 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  37.33 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  37.25 
 
 		 480 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  37.47 
 
 		 480 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  37.05 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  36.79 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  39.76 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  37.02 
 
 		 480 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  37.02 
 
 		 480 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  37.02 
 
 		 480 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  40.14 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  36.24 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  39.9 
 
 		 475 aa  296  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  37.26 
 
 		 452 aa  292  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  36.63 
 
 		 482 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  36.63 
 
 		 482 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  39.54 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  37.35 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  39.17 
 
 		 450 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  38.35 
 
 		 452 aa  289  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  35.36 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  36.97 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  36.97 
 
 		 454 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  36.97 
 
 		 454 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  36.73 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  35.14 
 
 		 480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  36.82 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  36.3 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  35.38 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  36.3 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  36.8 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  35.14 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  35.14 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  35.14 
 
 		 454 aa  279  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  34.38 
 
 		 454 aa  279  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  35.94 
 
 		 494 aa  279  9e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  35.9 
 
 		 452 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  33.56 
 
 		 481 aa  276  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  35.73 
 
 		 451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  35.9 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  37.02 
 
 		 480 aa  272  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  37.03 
 
 		 451 aa  272  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  33.63 
 
 		 491 aa  270  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  33.63 
 
 		 491 aa  270  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  33.63 
 
 		 491 aa  270  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  34.62 
 
 		 453 aa  269  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  35.07 
 
 		 454 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  34.83 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  37.2 
 
 		 463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  35.02 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  34.76 
 
 		 481 aa  266  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  33.63 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  34.07 
 
 		 454 aa  266  8e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  33.85 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  39.62 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  34.2 
 
 		 492 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  33.49 
 
 		 492 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  34.62 
 
 		 477 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  35.21 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  33.79 
 
 		 478 aa  236  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  30.88 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  32.94 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  37.87 
 
 		 456 aa  229  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  32.93 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  33.25 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  32.24 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  35.39 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  33.74 
 
 		 471 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  36.77 
 
 		 454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000256  putative magnesium transporter MgtE  37.14 
 
 		 448 aa  212  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  32.14 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  32.9 
 
 		 481 aa  209  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  33.85 
 
 		 473 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  33.25 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  32.38 
 
 		 470 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>