More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2528 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 
163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.82 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  49.66 
 
 
166 aa  133  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  48.28 
 
 
165 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  40.32 
 
 
189 aa  127  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.59 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  56.31 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  56.31 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  55.34 
 
 
169 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  55.34 
 
 
166 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  55.34 
 
 
167 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.21 
 
 
166 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  46.21 
 
 
166 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.21 
 
 
166 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.29 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  55.34 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  38.69 
 
 
172 aa  117  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.78 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.24 
 
 
172 aa  114  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  34.86 
 
 
181 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  38.1 
 
 
175 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.8 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  49.57 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  40.8 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  54.81 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.82 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.06 
 
 
199 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.85 
 
 
188 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  40.82 
 
 
181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.4 
 
 
185 aa  111  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  38.92 
 
 
181 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  48.04 
 
 
194 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.21 
 
 
170 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  36.93 
 
 
177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  40.85 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.54 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.78 
 
 
179 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  52 
 
 
200 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
184 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3118  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.96 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.396871  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  37.22 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0466  OmpA/MotB domain-containing protein  43.36 
 
 
203 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.3 
 
 
168 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.53 
 
 
196 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
199 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  49.49 
 
 
194 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  50.98 
 
 
135 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  45.37 
 
 
168 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  45.37 
 
 
168 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0950  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.92 
 
 
179 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.660653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  49.51 
 
 
179 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  49.56 
 
 
167 aa  104  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.22 
 
 
182 aa  104  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  46.9 
 
 
193 aa  104  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  49.49 
 
 
170 aa  104  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  48 
 
 
181 aa  103  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1069  outer membrane protein P6 precursor  51.92 
 
 
178 aa  104  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.427526  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0567  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.96 
 
 
188 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22731  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.74 
 
 
166 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  50.49 
 
 
177 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  41.83 
 
 
161 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.19 
 
 
163 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  35.19 
 
 
163 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 
163 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  38.07 
 
 
174 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.49 
 
 
175 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.81 
 
 
155 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000523751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  47.06 
 
 
194 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  49.04 
 
 
174 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  47.12 
 
 
180 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.08 
 
 
127 aa  100  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  48 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 
204 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 
199 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.23 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.75 
 
 
163 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.23 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.23 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.55 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  45.05 
 
 
211 aa  99  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.17 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.31 
 
 
167 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  47 
 
 
153 aa  99  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2018  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.17 
 
 
195 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.590364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  44.35 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0176  putative peptidoglycan-associated lipoprotein  47.17 
 
 
182 aa  98.6  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.340213  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0860  OmpA/MotB domain-containing protein  46.23 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.128552  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.96 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.67 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  47 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.28 
 
 
173 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  42.37 
 
 
180 aa  97.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  48.51 
 
 
182 aa  97.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 
173 aa  97.4  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 
173 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>