54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1840 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1840  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00716362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1659  cyclic nucleotide-binding protein  93.81 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2717  cyclic nucleotide binding protein, putative  92.04 
 
 		 226 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2501  cyclic nucleotide-binding protein  93.81 
 
 		 226 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0611932  hitchhiker  0.00056277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3273  cyclic nucleotide binding protein, putative  65.92 
 
 		 238 aa  315  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  normal  0.0894571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3786  cyclic nucleotide-binding protein  63.68 
 
 		 223 aa  307  9e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3424  cyclic nucleotide-binding protein  62.05 
 
 		 226 aa  297  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0003  putative cyclic nucleotide binding protein  45.95 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000897853  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000333  predicted N-ribosylNicotinamide CRP-like regulator  42.86 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000153311  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4298  cyclic nucleotide binding protein, putative  42.79 
 
 		 224 aa  193  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06137  hypothetical protein  41.96 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3489  cyclic nucleotide-binding protein  41.89 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0546  cyclic nucleotide-binding protein  41.74 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0551  cyclic nucleotide-binding protein  41.74 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3793  cyclic nucleotide-binding protein  41.74 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3683  cyclic nucleotide binding protein, putative  31.09 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1924  cyclic nucleotide binding protein, putative  32.42 
 
 		 222 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  25.94 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.48 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00758  putative transcriptional regulator (Crp family) protein  24.26 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.39 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0091  hypothetical protein  24.61 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.86 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0388  cyclic nucleotide-binding protein  24.3 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  27.27 
 
 		 266 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.38 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.04 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.74 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  22 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.07 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  25.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  25.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  21.84 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  25.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  25.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.72 
 
 		 230 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 229 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 243 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 228 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.03 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>