225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1054 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  99.36 
 
 		 468 aa  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  99.15 
 
 		 468 aa  896    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  78.56 
 
 		 471 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  100 
 
 		 468 aa  907    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  99.15 
 
 		 468 aa  896    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  98.5 
 
 		 465 aa  856    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  99.15 
 
 		 468 aa  896    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  53.23 
 
 		 468 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  53.02 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  51.51 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  51.51 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  51.29 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  49.04 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  48.83 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  48.61 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  42.83 
 
 		 465 aa  355  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  44.47 
 
 		 472 aa  353  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  45.19 
 
 		 499 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  43.09 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  39.48 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  41.91 
 
 		 471 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  40.33 
 
 		 490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  41.78 
 
 		 482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  40.72 
 
 		 479 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  41.06 
 
 		 498 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  37.07 
 
 		 487 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  39.24 
 
 		 488 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  37.93 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.92 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  35.93 
 
 		 441 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1580  flagellar hook-associated 2 domain protein  39.42 
 
 		 473 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  38.27 
 
 		 665 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  33.76 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  35.6 
 
 		 452 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.12 
 
 		 680 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.12 
 
 		 680 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.15 
 
 		 678 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.15 
 
 		 678 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  32.77 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.6 
 
 		 477 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  35.67 
 
 		 668 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.24 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  35.38 
 
 		 677 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  33.96 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.96 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.17 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.81 
 
 		 473 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  34.49 
 
 		 669 aa  176  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  34.49 
 
 		 685 aa  176  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.13 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 657 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.85 
 
 		 505 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.48 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.24 
 
 		 487 aa  170  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 454 aa  170  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  33.05 
 
 		 505 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.19 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.77 
 
 		 500 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  32.78 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  31.59 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  30.64 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.97 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.65 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.72 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.95 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.55 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  31.56 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.69 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.85 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  30.98 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.67 
 
 		 451 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  30.33 
 
 		 469 aa  153  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.21 
 
 		 456 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  26.42 
 
 		 478 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  28.55 
 
 		 541 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  33.97 
 
 		 472 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  28.91 
 
 		 541 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 457 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  31.67 
 
 		 452 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.62 
 
 		 468 aa  149  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  30.5 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.02 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.36 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  29.96 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.83 
 
 		 504 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  29.38 
 
 		 487 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  30.42 
 
 		 504 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.42 
 
 		 504 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.81 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.61 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  28.82 
 
 		 692 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  30.15 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2560  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.7 
 
 		 514 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  30.15 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  34.1 
 
 		 506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  30.15 
 
 		 507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3953  flagellar hook-associated protein  34.1 
 
 		 506 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  30.15 
 
 		 507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>