More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0275 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  100 
 
 
236 aa  478  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0390  putative acyltransferase  99.32 
 
 
146 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.141633  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3266  putative transferase  98.63 
 
 
146 aa  291  8e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482396  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0424  putative acyltransferase  98.63 
 
 
146 aa  291  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0384  putative acyltransferase  97.95 
 
 
146 aa  288  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3247  putative acyltransferase  100 
 
 
147 aa  278  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  35.36 
 
 
403 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  33.72 
 
 
404 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.58 
 
 
397 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  34.09 
 
 
400 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  40.15 
 
 
403 aa  96.3  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  35.54 
 
 
401 aa  95.5  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  28.25 
 
 
414 aa  90.9  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  32.93 
 
 
399 aa  91.3  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  29.63 
 
 
411 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.33 
 
 
400 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  29.94 
 
 
411 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  29.94 
 
 
411 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  33.75 
 
 
400 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.69 
 
 
396 aa  89  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  35.1 
 
 
399 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.33 
 
 
400 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  30.51 
 
 
411 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  34.69 
 
 
400 aa  85.1  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  33.94 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  30.13 
 
 
212 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  29.45 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  31.87 
 
 
385 aa  77  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  23.86 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  27.33 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.08 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  27.33 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  27.33 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  31.37 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  26.73 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  26.67 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.47 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  28.67 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  32.24 
 
 
405 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  29.17 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0086  sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.42 
 
 
377 aa  68.6  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.387197  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  29.45 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  27.22 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  29.14 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.08 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1777  nucleotidyl transferase  33.97 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13003  normal  0.0200486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0091  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.86 
 
 
453 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  29.03 
 
 
393 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  27.81 
 
 
417 aa  62.4  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2605  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  32.16 
 
 
458 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488351  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1694  nucleotidyl transferase  28.75 
 
 
363 aa  62  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00229332  normal  0.012326 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0427  nucleotidyl transferase  34.68 
 
 
363 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195694  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  30.46 
 
 
397 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0529  hexapaptide repeat-containing transferase  26.23 
 
 
350 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1356  Nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
360 aa  58.9  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1784  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.07 
 
 
452 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.907512  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  40.24 
 
 
388 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2151  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.2 
 
 
455 aa  58.5  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  24.39 
 
 
397 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1001  nucleotidyl transferase  30.72 
 
 
363 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0173  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.2 
 
 
455 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1784  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.07 
 
 
452 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  29.56 
 
 
841 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2933  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.86 
 
 
452 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.277455  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2617  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.48 
 
 
452 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263723  hitchhiker  0.00106881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4168  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.61 
 
 
430 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1246  nucleotidyl transferase  27.93 
 
 
457 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300235  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  29.37 
 
 
840 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.74 
 
 
393 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0017  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.76 
 
 
485 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2742  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  32.73 
 
 
476 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.19388 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.1 
 
 
393 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  25.93 
 
 
361 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  27.81 
 
 
361 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2855  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.13 
 
 
452 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1370  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  35.48 
 
 
455 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.329837  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  27.43 
 
 
842 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03117  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.46 
 
 
447 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0894  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.88 
 
 
468 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0312  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.33 
 
 
462 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.15443  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  25.76 
 
 
417 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0657  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.61 
 
 
491 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  27.23 
 
 
413 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  29.1 
 
 
377 aa  52.4  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  23.08 
 
 
334 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1604  nucleotidyl transferase  24.07 
 
 
352 aa  52.4  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0798438  normal  0.128956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3303  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / diamine N-acetyltransferase  26.67 
 
 
459 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2367  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.55 
 
 
453 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2981  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.55 
 
 
453 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3684  nucleotidyl transferase  25.56 
 
 
457 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000826363 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2163  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.54 
 
 
454 aa  52  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5504  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.04 
 
 
451 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3001  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.64 
 
 
453 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.64 
 
 
357 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0482  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  30 
 
 
457 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  28.48 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.39 
 
 
842 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3606  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.72 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.311729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  30.63 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>