53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3729 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  790    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  41.69 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  41.47 
 
 
388 aa  272  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  40.84 
 
 
388 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  37.5 
 
 
396 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  36.51 
 
 
397 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  36.95 
 
 
485 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  31.41 
 
 
434 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  32.89 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  33.78 
 
 
383 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  32.05 
 
 
424 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  31.5 
 
 
409 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  32.09 
 
 
381 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  32.88 
 
 
386 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  28.04 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  30.08 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  30.08 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  30.08 
 
 
416 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  32.15 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  32.64 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  31.83 
 
 
383 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  31.82 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  31.56 
 
 
383 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  31.56 
 
 
383 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  33.6 
 
 
385 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  30.37 
 
 
419 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  33.24 
 
 
383 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  34.04 
 
 
382 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  30.34 
 
 
384 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  30.73 
 
 
422 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  31.86 
 
 
374 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  33.06 
 
 
386 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  31.23 
 
 
385 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  30.31 
 
 
375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  33.23 
 
 
334 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  28.72 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  30.97 
 
 
416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  31.47 
 
 
412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  31.02 
 
 
391 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  30.18 
 
 
424 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  29.5 
 
 
411 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  31.87 
 
 
383 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  28.53 
 
 
393 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  29.29 
 
 
423 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  30.42 
 
 
390 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  31.7 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  25.08 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  25.26 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  25.26 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  24.37 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  25 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  24.84 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  22.78 
 
 
461 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>