More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2313 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  100 
 
 		 252 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  62.2 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  50.48 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  46.72 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 280 aa  188  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  48.51 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 		 397 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 278 aa  85.9  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1251  Methyltransferase type 11  33.74 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000494899  normal  0.377886 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2622  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.179692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  30 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  29.51 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  32.95 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  30.86 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  33.68 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7199  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  32.8 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  30.86 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  34.86 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  32.09 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.49 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.04 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.33 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.43 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  29.24 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  28.15 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.45 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  26.29 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  28.33 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  28.33 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  28.33 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.87 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.57 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.15 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.15 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2017  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  34.48 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.81 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  26.89 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.5 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.5 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.73 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.5 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.03 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.5 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.5 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.15 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  31.9 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  33.1 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  34.19 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.35 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.61 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.65 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.61 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  29.13 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.13 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  32.43 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  25.59 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>