More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0967 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 442 aa  884    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 439 aa  551  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 443 aa  549  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  51.12 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.25 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 447 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 453 aa  359  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 444 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 433 aa  306  7e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 472 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 477 aa  282  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 477 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 465 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 465 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 488 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 468 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 485 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 508 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 490 aa  249  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 482 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 482 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 488 aa  246  6e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 481 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 881 aa  243  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 469 aa  240  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 477 aa  239  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 484 aa  236  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 483 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 464 aa  233  6e-60  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 478 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 469 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 469 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 466 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 481 aa  231  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 473 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 493 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 484 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 484 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 492 aa  229  9e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 469 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  34.27 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 498 aa  228  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 488 aa  227  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 496 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 467 aa  227  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  33.61 
 
 		 518 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 466 aa  226  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 476 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 475 aa  226  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>