67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4493 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4493  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.809793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  24.54 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0963  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.679672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0660  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  24 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 305 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  32.43 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  27.18 
 
 		 541 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  27.18 
 
 		 541 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  27.18 
 
 		 541 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  27.18 
 
 		 541 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  36.51 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  27.18 
 
 		 541 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  31.86 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  40 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  38.6 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  42.11 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  34.81 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  33.33 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  40.35 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  33.78 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 319 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  26.75 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  42.37 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  26.75 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  41.51 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  22.29 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  38.18 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  51.11 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  38.6 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  27.93 
 
 		 663 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.13 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  22.14 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  32.26 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.15 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  30.61 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  26.87 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  30.33 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2920  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.41 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.41 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 152 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  22.31 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.61 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  29.66 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  25.13 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2753  methyltransferase type 12  29.94 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  28.08 
 
 		 207 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  30 
 
 		 256 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  39.39 
 
 		 206 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  33.33 
 
 		 209 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 195 aa  42  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.9 
 
 		 232 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  27.22 
 
 		 265 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  36.49 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 		 246 aa  41.6  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  36.49 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  36.49 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>