More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3858 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  91.68 
 
 		 481 aa  813    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  100 
 
 		 481 aa  951    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.12 
 
 		 488 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  64.42 
 
 		 493 aa  571  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  69.49 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  62.3 
 
 		 500 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.93 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.54 
 
 		 491 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  65.71 
 
 		 485 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.59 
 
 		 480 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  65.71 
 
 		 485 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  65.71 
 
 		 485 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  67.44 
 
 		 488 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.64 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  65.13 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  68.84 
 
 		 541 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.98 
 
 		 486 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  66.6 
 
 		 504 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.97 
 
 		 517 aa  528  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.04 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  66.67 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  65.41 
 
 		 482 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  65.15 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  64.86 
 
 		 519 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  61.46 
 
 		 513 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  69 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.68 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  65.2 
 
 		 454 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  58.48 
 
 		 509 aa  500  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.78 
 
 		 450 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  59.58 
 
 		 529 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  59.21 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11560  GTPase ObgE  63.05 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.32436 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  58.84 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  57.26 
 
 		 509 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  61.23 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  53.05 
 
 		 563 aa  433  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  51.66 
 
 		 560 aa  403  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.53 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.56 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.8 
 
 		 482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.64 
 
 		 463 aa  336  5.999999999999999e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  44.39 
 
 		 427 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  45.07 
 
 		 422 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.5 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.93 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.96 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.69 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  46.76 
 
 		 432 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  45.35 
 
 		 430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  45.35 
 
 		 430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  45.35 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  45.22 
 
 		 435 aa  312  9e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  43.93 
 
 		 424 aa  309  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  40.8 
 
 		 423 aa  309  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.62 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.57 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  52.22 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  44.65 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  43.36 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  43.36 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  42.89 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  42.89 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  43.36 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  42.66 
 
 		 428 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  42.89 
 
 		 428 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  42.66 
 
 		 428 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  42.96 
 
 		 427 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  55.96 
 
 		 354 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  55.96 
 
 		 354 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  47.41 
 
 		 423 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  53.92 
 
 		 353 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  55.66 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.58 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  46.35 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  42.79 
 
 		 434 aa  294  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  42.89 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  42.62 
 
 		 428 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.26 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  46.58 
 
 		 439 aa  293  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.24 
 
 		 338 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.01 
 
 		 425 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.36 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.84 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.29 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.3 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.79 
 
 		 429 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.47 
 
 		 415 aa  283  7.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.14 
 
 		 434 aa  282  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  41.78 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  50.31 
 
 		 338 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  50.46 
 
 		 338 aa  279  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.48 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  49.38 
 
 		 338 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  46.65 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50 
 
 		 338 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  41.49 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  48.21 
 
 		 387 aa  276  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  41.84 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  41.84 
 
 		 424 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>