25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2763 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  79.48 
 
 
498 aa  700    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  950    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  40.21 
 
 
809 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  36.15 
 
 
757 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  28.17 
 
 
817 aa  83.6  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  29.82 
 
 
441 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  34.55 
 
 
684 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  31.33 
 
 
428 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  31.5 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  30.8 
 
 
452 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  29.75 
 
 
427 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  30.04 
 
 
431 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  29.03 
 
 
418 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  29.22 
 
 
619 aa  60.1  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  30.95 
 
 
1197 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  29.24 
 
 
461 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  25.24 
 
 
537 aa  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  29.57 
 
 
435 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  29.38 
 
 
753 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  28.82 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  27.64 
 
 
680 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  30 
 
 
395 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  30.33 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  27.02 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  30.08 
 
 
385 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>