86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2507 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2507  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 260 aa  502  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366976  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2356  endonuclease/exonuclease/phosphatase  81.78 
 
 		 259 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  normal  0.0671284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.85 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.89 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.89 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.89 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.89 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.57 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0929  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.44 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1174  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.66 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834262  normal  0.168848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0330  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.66 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0263555  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.61 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.15 
 
 		 329 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.3 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.75 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.33 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.89 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  34.6 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.93 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.85 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.82 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.12 
 
 		 808 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.33 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  30.58 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.39 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.71 
 
 		 266 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.98 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  26.95 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.3 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.72 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.57 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.64 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.03 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.64 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.74 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.94 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.56 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.74 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.18 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.35 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.7 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.02 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.89 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 		 837 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.35 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.43 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.91 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.08 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  30.04 
 
 		 617 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.14 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.57 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.47 
 
 		 576 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.36 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.83 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.96 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.91 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.28 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.2 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.84 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.08 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.08 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.07 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.36 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.67 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 		 288 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0170416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>