More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2121 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  59.51 
 
 
314 aa  338  8e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  32.46 
 
 
409 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 
303 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  32.36 
 
 
408 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  34.13 
 
 
742 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  32.46 
 
 
384 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  31.79 
 
 
358 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  33.04 
 
 
390 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  33.97 
 
 
312 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
319 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  32 
 
 
510 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.9 
 
 
826 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  30.14 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  30.56 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.97 
 
 
751 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  31.42 
 
 
586 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  33.72 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  33.72 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.09 
 
 
829 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  31.49 
 
 
614 aa  109  5e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  36.68 
 
 
337 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  32.65 
 
 
253 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.85 
 
 
517 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
621 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.65 
 
 
325 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  33.94 
 
 
319 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  31.31 
 
 
304 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  32.93 
 
 
351 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  29.91 
 
 
351 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  29.45 
 
 
330 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  31.08 
 
 
290 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.34 
 
 
433 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
329 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.58 
 
 
348 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  32.52 
 
 
331 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  31.08 
 
 
290 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  31.63 
 
 
324 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  31.08 
 
 
290 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  33.24 
 
 
375 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  33.84 
 
 
444 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  32.21 
 
 
481 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  31.1 
 
 
301 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  32.84 
 
 
303 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  33.02 
 
 
311 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  30.3 
 
 
384 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
367 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  28.25 
 
 
332 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  33.56 
 
 
251 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  34.88 
 
 
327 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  33.56 
 
 
766 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.45 
 
 
348 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  29.56 
 
 
287 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  34.35 
 
 
334 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  31.85 
 
 
307 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  36.03 
 
 
337 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  32.81 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  31.47 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  31.99 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.55 
 
 
390 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  34.5 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  33.04 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  29.14 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  32.96 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
861 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  32.68 
 
 
417 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  31.97 
 
 
352 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  32.54 
 
 
444 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  33.73 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  32.78 
 
 
549 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  32.78 
 
 
600 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  30.51 
 
 
341 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  31.32 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  30.17 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  30.96 
 
 
265 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.94 
 
 
439 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  32.26 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  32 
 
 
336 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  30.9 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  32.54 
 
 
291 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 
416 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  29.13 
 
 
310 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  31.48 
 
 
318 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  35.81 
 
 
300 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  32.14 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  30.82 
 
 
628 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  37.37 
 
 
349 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  30.3 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  31.19 
 
 
412 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  31.6 
 
 
351 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  30.25 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  34 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  30.9 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  29.87 
 
 
290 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  33.73 
 
 
306 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  31.15 
 
 
468 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1587  hypothetical protein  34.11 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>