44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1814 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  100 
 
 		 456 aa  859    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  76.29 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0322  major facilitator superfamily MFS_1  42.5 
 
 		 422 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  28.88 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  26.46 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 432 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 462 aa  53.5  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  25.66 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.68 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.68 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  29.81 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  29.81 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  29.81 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  21.78 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 384 aa  43.5  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  24.18 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 409 aa  43.5  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  38.6 
 
 		 423 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>