43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3381 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  352  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  69.06 
 
 		 182 aa  250  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  68.51 
 
 		 182 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  68.51 
 
 		 182 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  67.96 
 
 		 182 aa  247  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  67.96 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  67.8 
 
 		 182 aa  245  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  64.44 
 
 		 186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  62.36 
 
 		 182 aa  231  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  66.85 
 
 		 182 aa  229  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  67.8 
 
 		 182 aa  228  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  67.23 
 
 		 182 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  62.43 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  66.29 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  42.25 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  66.96 
 
 		 127 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  45.36 
 
 		 194 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  43.33 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  40.98 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  43.58 
 
 		 186 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  47.97 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  45.66 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  35.8 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  35.96 
 
 		 213 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  35.96 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  38.65 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  40.7 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  38.41 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  48.04 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  43.33 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  43.75 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  45 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  43.33 
 
 		 220 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  38.28 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  38.28 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  42 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  39.88 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  32.8 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  35.38 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.05 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0339  hypothetical protein  79.07 
 
 		 44 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  28.93 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  28.3 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>