More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1118 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0222  elongation factor G  46.27 
 
 		 683 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3749  elongation factor G  50 
 
 		 688 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.158222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  47.56 
 
 		 680 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6425  elongation factor G  47.94 
 
 		 681 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000680  translation elongation factor G-related protein  47.01 
 
 		 674 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  49.56 
 
 		 700 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2663  elongation factor G  71.45 
 
 		 682 aa  1010    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  48.58 
 
 		 684 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3200  elongation factor G  71.47 
 
 		 682 aa  1011    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1118  elongation factor G  100 
 
 		 682 aa  1387    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  47.23 
 
 		 730 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5542  elongation factor G  48.87 
 
 		 686 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1382  elongation factor G  45.48 
 
 		 684 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4182  elongation factor G  46.9 
 
 		 686 aa  588  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  36.53 
 
 		 695 aa  452  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  34.83 
 
 		 688 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  35.61 
 
 		 679 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  35.94 
 
 		 683 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  36.35 
 
 		 691 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  36.03 
 
 		 683 aa  425  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  34.93 
 
 		 682 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  35.33 
 
 		 696 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  33.43 
 
 		 685 aa  419  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  35.33 
 
 		 690 aa  422  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  33.72 
 
 		 695 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  34.59 
 
 		 692 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  34.3 
 
 		 696 aa  415  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  34.26 
 
 		 696 aa  412  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  32.99 
 
 		 694 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  32.85 
 
 		 690 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  36.54 
 
 		 683 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  34.53 
 
 		 680 aa  402  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  34.71 
 
 		 685 aa  399  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  35.98 
 
 		 703 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  33.53 
 
 		 691 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  35.24 
 
 		 656 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  36.24 
 
 		 686 aa  391  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  33.71 
 
 		 707 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  32.46 
 
 		 691 aa  392  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  34.25 
 
 		 690 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32.76 
 
 		 697 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  32.55 
 
 		 691 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  34.81 
 
 		 719 aa  392  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  32.8 
 
 		 692 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  33.91 
 
 		 692 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.44 
 
 		 701 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  33 
 
 		 697 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  35.23 
 
 		 683 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  32.13 
 
 		 696 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  32.36 
 
 		 696 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  33.09 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  34.59 
 
 		 707 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  33.48 
 
 		 691 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  32.64 
 
 		 719 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  32.07 
 
 		 703 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  31.97 
 
 		 691 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  32.31 
 
 		 697 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.16 
 
 		 682 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  33.48 
 
 		 688 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  33.72 
 
 		 694 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  32.31 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  34.15 
 
 		 691 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  31.61 
 
 		 690 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  33.62 
 
 		 697 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  33.82 
 
 		 692 aa  382  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  31.39 
 
 		 691 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  32.56 
 
 		 689 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  33.97 
 
 		 688 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  32.95 
 
 		 692 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  33.67 
 
 		 682 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  32.8 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  31.56 
 
 		 693 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  33.57 
 
 		 673 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  32.66 
 
 		 692 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  32.66 
 
 		 692 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  32.42 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  34.81 
 
 		 701 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  36.52 
 
 		 717 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  31.89 
 
 		 697 aa  379  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  33.71 
 
 		 690 aa  379  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.42 
 
 		 692 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  32.66 
 
 		 692 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  30.54 
 
 		 695 aa  378  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  31.83 
 
 		 670 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  33.62 
 
 		 694 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  32.71 
 
 		 691 aa  378  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  32.42 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  31.34 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  34.9 
 
 		 701 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  32.13 
 
 		 692 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  32.94 
 
 		 667 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  32.02 
 
 		 691 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  32.27 
 
 		 692 aa  375  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  32.46 
 
 		 691 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  32.85 
 
 		 687 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  32.32 
 
 		 691 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  32.13 
 
 		 692 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  32.66 
 
 		 692 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  31.75 
 
 		 698 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  31.98 
 
 		 692 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>