More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0760 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 271 aa  554  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  59.61 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  60 
 
 		 321 aa  315  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  60 
 
 		 321 aa  315  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.21 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  58.82 
 
 		 293 aa  310  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  58.08 
 
 		 297 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  55.89 
 
 		 311 aa  308  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  58.08 
 
 		 297 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  55.09 
 
 		 308 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  58.08 
 
 		 297 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  58.08 
 
 		 297 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  57.81 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  55.39 
 
 		 279 aa  306  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  55.51 
 
 		 269 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  47.62 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  50 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  50 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 275 aa  234  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  49.36 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  49.36 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  49.36 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  44.76 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  48.5 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 		 263 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  50 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  45.67 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  44 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.37 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  43.31 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  45.71 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  45.42 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  41.82 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  40.7 
 
 		 261 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.59 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  41.6 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  43.15 
 
 		 384 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  45.34 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  41.04 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.87 
 
 		 409 aa  198  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  42.98 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  46.79 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.19 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  40.8 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  40.8 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.96 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  38.74 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  44 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  43.44 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.48 
 
 		 339 aa  188  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  39.44 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  38.56 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  44.63 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  36.86 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.2 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  37.15 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.83 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  44.05 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.82 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  39.36 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  36.9 
 
 		 418 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  40.55 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  36.36 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  39.29 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  41.18 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  39.41 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 536 aa  175  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 		 255 aa  175  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.8 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  38.4 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  35 
 
 		 455 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  38.4 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.89 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  35.83 
 
 		 490 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.06 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.2 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  39.91 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.09 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>