More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0541 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  56.44 
 
 		 611 aa  714    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  81.47 
 
 		 602 aa  1026    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  80.3 
 
 		 602 aa  1012    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  80.3 
 
 		 602 aa  1011    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  80.13 
 
 		 602 aa  1009    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  51.53 
 
 		 624 aa  657    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  74.25 
 
 		 600 aa  937    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  75.17 
 
 		 606 aa  960    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  76.42 
 
 		 609 aa  969    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  55.34 
 
 		 616 aa  676    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  81.3 
 
 		 602 aa  1023    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  81.47 
 
 		 602 aa  1026    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  74.87 
 
 		 610 aa  957    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  81.47 
 
 		 602 aa  1026    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  100 
 
 		 606 aa  1256    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  57.92 
 
 		 613 aa  709    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  74.79 
 
 		 623 aa  944    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  80.3 
 
 		 602 aa  1012    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  77.78 
 
 		 611 aa  986    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  80.47 
 
 		 602 aa  1009    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.22 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 267 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  25 
 
 		 621 aa  68.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  30.05 
 
 		 762 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  29.65 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.33 
 
 		 692 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 		 882 aa  67  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.05 
 
 		 662 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 		 381 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  24.29 
 
 		 457 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  30.53 
 
 		 774 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 		 691 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 		 761 aa  65.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  25.39 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  26.24 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  27.93 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12118  predicted protein  33.09 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6388  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  30.06 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  31.28 
 
 		 556 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  31.7 
 
 		 556 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0921  protein kinase  28.99 
 
 		 651 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0130475  normal  0.23221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1579  serine/threonine protein kinase  23.79 
 
 		 297 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 642 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 		 866 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  24.41 
 
 		 781 aa  62  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 895 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 531 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  31.43 
 
 		 556 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 752 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3751  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000729349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  23.11 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.11 
 
 		 653 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 		 1415 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41728  predicted protein  25.4 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000183464  hitchhiker  0.00347686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 		 600 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 		 985 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  24.54 
 
 		 666 aa  60.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  32.03 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6426  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.51 
 
 		 598 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1274  serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2673  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 540 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0573698  normal  0.794147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  22.81 
 
 		 907 aa  60.1  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.27 
 
 		 798 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 746 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  26.71 
 
 		 637 aa  59.3  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  23.71 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  24.24 
 
 		 604 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 		 1479 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.65 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  23.74 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1717  serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4231  cyclic nucleotide-binding protein  27.23 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.05 
 
 		 822 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  30.82 
 
 		 790 aa  58.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.67 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.14 
 
 		 591 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 894 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.94 
 
 		 1023 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 938 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0154  serine/threonine-protein kinase  26.82 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  31.4 
 
 		 684 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>