More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2945 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 439 aa  870    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 442 aa  557  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  67.12 
 
 		 443 aa  551  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  49.89 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 449 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 444 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 449 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 456 aa  360  2e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 453 aa  359  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.2 
 
 		 458 aa  356  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 447 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 444 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 433 aa  299  8e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 472 aa  292  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 465 aa  278  9e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 477 aa  264  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 468 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 473 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 485 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 475 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 465 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 474 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 463 aa  249  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 468 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 469 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 469 aa  246  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 469 aa  246  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 473 aa  245  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 482 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 470 aa  243  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 471 aa  243  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 509 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  36.65 
 
 		 546 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 488 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 496 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1690  glutamyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 468 aa  239  9e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 481 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 478 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 475 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 471 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 474 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 475 aa  236  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 468 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 488 aa  236  7e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 471 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 471 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 486 aa  236  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 481 aa  235  9e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2681  glutamyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 474 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>