More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2024 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2024  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 317 aa  621  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.908086  normal  0.0114447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2773  thiamine-monophosphate kinase  60 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  54.23 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  42.68 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  43.62 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  45.13 
 
 		 338 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  42.62 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  39.42 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  43.1 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  45 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  37.29 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  43.27 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  42.28 
 
 		 338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  41.48 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  43.6 
 
 		 324 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  35.19 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  43.67 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  41.78 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  42.28 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  43.36 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  40.13 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  35.55 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  38.08 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  37.95 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  38.08 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  44.19 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  37.77 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  36.91 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  31.56 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  40.45 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  37.05 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.88 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  38.78 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  39.01 
 
 		 320 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  39.18 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  37.03 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  34.98 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  34.98 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  35.94 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.94 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  34.98 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  37.62 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  35.94 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  38.81 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  37 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  34.95 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  37.99 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  38.81 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  39.14 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  37.99 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  37.46 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  36.42 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  36.3 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  40.33 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  40.33 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  40.33 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  40.33 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  34.44 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  40.33 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  40.33 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  40.33 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.85 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  35.62 
 
 		 326 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  35.31 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  35.31 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  39.33 
 
 		 357 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  35.31 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.01 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  39.13 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  35.62 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  38.54 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  36.28 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 		 339 aa  142  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  31.97 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  31.97 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  37.46 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  37.24 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  36.39 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.65 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  36.39 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  39.46 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  38.4 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  35.2 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  35.2 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  35.2 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  35.2 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  37.19 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  37.09 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  35.2 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  35.2 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  35.51 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  39.19 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  35.2 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  36.7 
 
 		 325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  29.15 
 
 		 314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  36.42 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0928  thiamine-monophosphate kinase  36.28 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1047  thiamine-monophosphate kinase  36.28 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  38.83 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>