74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1768 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1768  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1450  hemerythrin-like metal-binding protein  47.01 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000266024  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.3 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3052  hemerythrin-like metal-binding protein  30.08 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129112  normal  0.291698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.83 
 
 		 518 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.07 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1446  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  26.23 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  27.83 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  27.64 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  23.88 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.4 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  25.56 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  22.14 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  27.08 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.5 
 
 		 722 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  21.67 
 
 		 529 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.35 
 
 		 526 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  22.56 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  26.5 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.95 
 
 		 530 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.03 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.44 
 
 		 927 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  24.09 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.95 
 
 		 529 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.95 
 
 		 529 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.95 
 
 		 529 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.95 
 
 		 529 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  23.13 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  23.77 
 
 		 871 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.93 
 
 		 963 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20 
 
 		 529 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20 
 
 		 529 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  27.62 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  23.81 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20 
 
 		 529 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  25.41 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  20.9 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  25.66 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  25.22 
 
 		 736 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  23.47 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.52 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  28.1 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  28.69 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  22.5 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  23.58 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  25.96 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  20.49 
 
 		 667 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  23.48 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  23.93 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  21.67 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  25.76 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  26.73 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.49 
 
 		 518 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.17 
 
 		 779 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  26.83 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  23.53 
 
 		 133 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  19.83 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  27.72 
 
 		 153 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  21.05 
 
 		 173 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  23.08 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  26.67 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.12 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  24.24 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  28.92 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  28.92 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  25.97 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  22.64 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  26.45 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  23.93 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>