More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0353 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0353  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 220 aa  434  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 222 aa  205  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.41 
 
 		 218 aa  204  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.54 
 
 		 219 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 221 aa  194  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  45.83 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  42.53 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  42.53 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.84 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  43.12 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  43.05 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  42.92 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  42.6 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.09 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.73 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.73 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4389  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.73 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.44 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.44 
 
 		 227 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.44 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.44 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.44 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  42.79 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  42.79 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  42.08 
 
 		 223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  42.79 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  42.79 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  42.79 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  42.79 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  42.79 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4694  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.73278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  44.09 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  42.79 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  43.38 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.44 
 
 		 226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3875  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000900168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.2 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  44.29 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.34 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  39.04 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  42.59 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>