More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0145 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 812 aa  1604    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  50.68 
 
 		 824 aa  773    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  42.32 
 
 		 819 aa  606  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  42.47 
 
 		 829 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  40.86 
 
 		 826 aa  553  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 903 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 918 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  28.56 
 
 		 887 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  29.84 
 
 		 824 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  29.2 
 
 		 824 aa  351  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 1557 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 825 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 825 aa  333  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  27.51 
 
 		 811 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  27.26 
 
 		 1537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 1538 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 1538 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 1542 aa  271  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1232  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.02 
 
 		 402 aa  267  5e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.86 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 610 aa  255  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 610 aa  252  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2969  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 		 854 aa  250  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 572 aa  249  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 492 aa  246  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 610 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.81 
 
 		 610 aa  243  7e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  37.56 
 
 		 624 aa  242  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 576 aa  242  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 607 aa  240  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.1 
 
 		 602 aa  238  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 620 aa  237  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 592 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 599 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.53 
 
 		 598 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 605 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 570 aa  233  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 599 aa  232  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 603 aa  232  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 603 aa  231  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 599 aa  230  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 633 aa  229  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  34.38 
 
 		 592 aa  228  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  30.44 
 
 		 564 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 633 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 619 aa  227  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 602 aa  226  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 605 aa  225  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 662 aa  224  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  32.73 
 
 		 575 aa  224  4.9999999999999996e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 562 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  33.52 
 
 		 551 aa  224  7e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 593 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 612 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 605 aa  222  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 597 aa  221  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 632 aa  220  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 603 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.24 
 
 		 611 aa  219  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  32.78 
 
 		 510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 		 605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 600 aa  218  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 597 aa  217  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 602 aa  217  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 604 aa  216  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.21 
 
 		 599 aa  216  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 615 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  28.98 
 
 		 514 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 592 aa  214  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 601 aa  213  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 612 aa  213  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 		 597 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 608 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 605 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 596 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 591 aa  212  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 606 aa  211  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  29.04 
 
 		 508 aa  211  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 607 aa  211  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 609 aa  210  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 606 aa  210  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 599 aa  210  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 597 aa  210  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.54 
 
 		 557 aa  210  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 606 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 590 aa  210  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 602 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.96 
 
 		 512 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.5 
 
 		 599 aa  208  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  28.11 
 
 		 580 aa  207  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 580 aa  208  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 595 aa  207  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 553 aa  207  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 604 aa  207  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 605 aa  207  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 490 aa  207  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 599 aa  207  8e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 564 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>