257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0311 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1591  cation uptake protein  71.79 
 
 
475 aa  644    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0311  Trk-type K+ transport system, membrane component  100 
 
 
479 aa  952    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.766234  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  44.31 
 
 
485 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  39.75 
 
 
483 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  36.11 
 
 
479 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  37.11 
 
 
477 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.41 
 
 
480 aa  282  9e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  33.61 
 
 
479 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  37.66 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.49 
 
 
481 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  33.4 
 
 
478 aa  273  7e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.36 
 
 
482 aa  259  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.48 
 
 
466 aa  259  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  37.06 
 
 
482 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  34.84 
 
 
485 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  34.02 
 
 
483 aa  254  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  35.81 
 
 
481 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  34.22 
 
 
491 aa  253  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  32.79 
 
 
487 aa  252  9.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  36.55 
 
 
494 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  34.78 
 
 
486 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  31.34 
 
 
524 aa  249  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  33.95 
 
 
485 aa  247  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  34.44 
 
 
476 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  34.5 
 
 
483 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  33.95 
 
 
483 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  34.11 
 
 
483 aa  240  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  32.64 
 
 
485 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  32.23 
 
 
483 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  32.65 
 
 
482 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  35.52 
 
 
483 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  34.39 
 
 
481 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  33.47 
 
 
486 aa  230  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  33.69 
 
 
482 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  33.68 
 
 
485 aa  229  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  35.04 
 
 
483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  35.04 
 
 
483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  35.04 
 
 
483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  35.04 
 
 
483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  35.04 
 
 
483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  35.04 
 
 
483 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  32.75 
 
 
474 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  35.04 
 
 
483 aa  225  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  33.74 
 
 
483 aa  224  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  31.33 
 
 
486 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  33.27 
 
 
481 aa  223  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  32.02 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  33.4 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  32.58 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  34.77 
 
 
483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  33.12 
 
 
481 aa  221  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  30.91 
 
 
479 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  33.41 
 
 
484 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  30.6 
 
 
485 aa  221  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  33.81 
 
 
488 aa  220  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  34.43 
 
 
483 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  34.43 
 
 
483 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  34.43 
 
 
483 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  34.43 
 
 
483 aa  219  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  32.79 
 
 
491 aa  219  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  34.43 
 
 
483 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  34.43 
 
 
483 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  34.43 
 
 
483 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  34.43 
 
 
483 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  34.22 
 
 
483 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  33.47 
 
 
485 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  30.77 
 
 
514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  32.29 
 
 
478 aa  218  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  33.05 
 
 
481 aa  217  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  32.38 
 
 
485 aa  217  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  32.26 
 
 
498 aa  217  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  34.22 
 
 
483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  31.08 
 
 
483 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  33.26 
 
 
484 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  30.41 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  32.79 
 
 
485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  31.55 
 
 
485 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  31.55 
 
 
485 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  31.55 
 
 
485 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  31.55 
 
 
485 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  31.69 
 
 
485 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  31.69 
 
 
485 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  31.69 
 
 
485 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  33.26 
 
 
485 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  33.88 
 
 
483 aa  210  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  31.34 
 
 
485 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  29.08 
 
 
485 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  31.63 
 
 
488 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  31.13 
 
 
486 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  33.57 
 
 
495 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  31.53 
 
 
505 aa  204  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  32.26 
 
 
483 aa  203  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  34.43 
 
 
483 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  34.43 
 
 
483 aa  202  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  34.43 
 
 
483 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  29.96 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0635  cation transporter  33.6 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  32.49 
 
 
488 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  32.49 
 
 
488 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  30 
 
 
509 aa  199  7e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>