140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1583 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  97.92 
 
 		 337 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  97.92 
 
 		 337 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  97.63 
 
 		 337 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  95.25 
 
 		 337 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  94.66 
 
 		 337 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  95.25 
 
 		 337 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  95.25 
 
 		 337 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  94.96 
 
 		 337 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  77.15 
 
 		 336 aa  548  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  73.59 
 
 		 337 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  69.73 
 
 		 338 aa  511  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.98 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.85 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0759  hypothetical protein  48.65 
 
 		 364 aa  325  9e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0635712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  47.32 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  50.15 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  50 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  46.73 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.78 
 
 		 353 aa  315  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.45 
 
 		 340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0687  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.63 
 
 		 348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.05 
 
 		 344 aa  312  4.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.38 
 
 		 346 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.89 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  49.06 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  49.06 
 
 		 342 aa  309  5e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.84 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1548  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.95 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.59 
 
 		 343 aa  298  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.6 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.13 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.77 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.41 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.37 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3660  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.09 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  39.29 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1563  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  39.6 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  36.59 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1417  hypothetical protein  38.1 
 
 		 333 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.48 
 
 		 426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.53 
 
 		 481 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.53 
 
 		 326 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0100  deacylase-like  36.67 
 
 		 510 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1973  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.54 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0907521 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3124  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.54 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0932  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.47 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2075  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.65 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.763346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1798  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.93 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000544657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1426  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.79 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3168  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.76 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0298  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.11 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0428528 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.08 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0644  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.1 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0516  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.48 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0840  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.93 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.678426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1255  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.82 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2911  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.91 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05665  hypothetical protein  28.68 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4403  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.56 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2731  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.68 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4379  ectoine utilization protein EutE  31.54 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.57 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  28.57 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4117  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.36 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4703  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.75 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.261304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.61 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3861  ectoine utilization protein EutE  30.63 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000043  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.79 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0058  hypothetical protein  30.23 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.630853  hitchhiker  0.00778397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2694  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.62 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.620459  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0849  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.53 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.470492  normal  0.0879559 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  30.05 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4423  hypothetical protein  29.89 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112678 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22840  predicted deacylase  27.14 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3854  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.47 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3576  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.53 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107365  normal  0.907125 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5522  ectoine utilization protein EutE  30.6 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3466  ectoine utilization protein EutE  28.85 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681288  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0386  hypothetical protein  28.12 
 
 		 332 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5802  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.51 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6021  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6166  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.51 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5777  ectoine utilization protein EutE  30 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0434759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2148  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.75 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3178  hypothetical protein  29.23 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.860392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0288  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.67 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6647  ectoine utilization protein EutE  29.51 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.35 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.09 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000633  succinate dehydrogenase subunit  25.95 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6142  ectoine utilization protein EutE  28.23 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.69 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5243  ectoine utilization protein EutE  28.73 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.472707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3134  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.4 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0643  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.88 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0486268  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3856  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.11 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.404909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4317  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.74 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.925713 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2412  hypothetical protein  27.08 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>