More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2368 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2368  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2539  ABC transporter related  69.35 
 
 		 249 aa  348  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000292803  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2490  ABC transporter related  69.35 
 
 		 249 aa  348  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  40.16 
 
 		 546 aa  175  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.04 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.04 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  36.99 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 602 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  37.65 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3236  ABC peptide transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3973  ABC transporter related  36.4 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  37.79 
 
 		 555 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2757  ABC transporter related  40.41 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  36.59 
 
 		 538 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.26 
 
 		 307 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2346  ABC transporter related  36.75 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0347  ABC transporter related  38.91 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  38.28 
 
 		 547 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2617  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0151151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  37.4 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  37.02 
 
 		 559 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3967  hypothetical protein  36 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420932  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 541 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0472  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  37.11 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  36.22 
 
 		 350 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  36 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0389  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.15 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  36.65 
 
 		 573 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2633  ABC transporter-related protein  36.75 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0173  ABC transporter related  36.14 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  36.61 
 
 		 617 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  39.2 
 
 		 579 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  37.4 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  36.73 
 
 		 285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.9 
 
 		 337 aa  165  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  37.33 
 
 		 285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  38.08 
 
 		 308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  36.65 
 
 		 270 aa  164  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 337 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 337 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 337 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 337 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 337 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  36.65 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.65 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  37.8 
 
 		 627 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  37.69 
 
 		 543 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2960  ABC transporter related  36.51 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  36.69 
 
 		 534 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  36.65 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1552  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.37 
 
 		 324 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  38.03 
 
 		 597 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 		 547 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  36.03 
 
 		 530 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 539 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  35.8 
 
 		 575 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  36.02 
 
 		 556 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 334 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  38.49 
 
 		 548 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  35.46 
 
 		 339 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  34.21 
 
 		 605 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0213  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 		 334 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0189  ABC transporter-related protein  34.4 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1780  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  36.86 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1888  ABC transporter related  36.86 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.26331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2544  peptide transport system ATP-binding protein  36.86 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  36.29 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  38.43 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  37.82 
 
 		 544 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  37.82 
 
 		 544 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0176  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2236  ATPase  35.69 
 
 		 554 aa  161  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.274783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  35.9 
 
 		 268 aa  161  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00733076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  38 
 
 		 565 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  35.55 
 
 		 339 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  36.97 
 
 		 536 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 		 543 aa  161  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0061  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 		 290 aa  161  9e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.294257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0189  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  35.34 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1714  ABC transporter related  35.04 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0188  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  35.34 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  35.9 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  35.9 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  35.9 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  35.9 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0232  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  37.94 
 
 		 530 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  37.82 
 
 		 544 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  35.9 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>