More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2539 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2490  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2539  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000292803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2368  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  69.35 
 
 
249 aa  348  6e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  45.81 
 
 
254 aa  193  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2757  ABC transporter related  40.64 
 
 
253 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  37.6 
 
 
538 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0926  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161343  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  37.45 
 
 
534 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1231  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
261 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  37.55 
 
 
276 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3403  ABC transporter related  36.9 
 
 
538 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.74 
 
 
680 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  39.38 
 
 
350 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  37.85 
 
 
540 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  38.28 
 
 
282 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  36.82 
 
 
285 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  37.85 
 
 
546 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0347  ABC transporter related  40.34 
 
 
320 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 
544 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  38.1 
 
 
545 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.17 
 
 
294 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2502  ABC transporter-related protein  35.97 
 
 
261 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
282 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  38.28 
 
 
547 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2960  ABC transporter related  36.9 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  36.95 
 
 
308 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.3 
 
 
307 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1975  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
285 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  33.33 
 
 
285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  38.4 
 
 
534 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0173  ABC transporter related  36.95 
 
 
257 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2486  ABC transporter related  36.86 
 
 
261 aa  164  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1801  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  37.5 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 
540 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0472  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
326 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1634  ABC transporter related  35.18 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
669 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2743  ABC transporter related  35.18 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.39241  normal  0.48715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2488  ABC transporter related  35.97 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1600  ABC transporter related  35.18 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00484848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2654  ABC transporter related  35.97 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  33.33 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1611  ABC transporter related  35.18 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  36.36 
 
 
538 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  38.49 
 
 
546 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
609 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  38.26 
 
 
246 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  37.96 
 
 
550 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5134  putative peptide ABC transporter ATP-binding protein, oppF-like protein  40.56 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  38.1 
 
 
549 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  39.83 
 
 
570 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
534 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  36.76 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  39.11 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2556  ABC transporter related  35.57 
 
 
261 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595528  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 
443 aa  161  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  38.68 
 
 
549 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  38 
 
 
550 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  37.05 
 
 
545 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  37.2 
 
 
532 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  35.41 
 
 
534 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.5 
 
 
547 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2584  ABC transporter related  35.16 
 
 
261 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0346  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 
572 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
323 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  36 
 
 
261 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  39.15 
 
 
564 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0176  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
257 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  38.26 
 
 
251 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  38.25 
 
 
527 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
539 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  38.98 
 
 
559 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4852  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
261 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.059944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  40 
 
 
579 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0175  ABC transporter related  37.85 
 
 
266 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0977018  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  38.98 
 
 
559 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3617  ABC transporter-related protein  35.54 
 
 
289 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.606564  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  36.36 
 
 
313 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
257 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0179  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
257 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  36.67 
 
 
631 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0213  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
257 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  39.64 
 
 
549 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  36.32 
 
 
251 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  37.55 
 
 
617 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  37.45 
 
 
555 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3967  hypothetical protein  34.51 
 
 
282 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420932  normal  0.148579 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01267  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  35.62 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  35.62 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  35.62 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  35.62 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  35.62 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
257 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  35.62 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  35.62 
 
 
268 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1497  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  35.62 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0232  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
257 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2675  ABC transporter related  37.94 
 
 
261 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>