More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1137 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  315  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  80.65 
 
 		 155 aa  259  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  80.65 
 
 		 155 aa  259  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  57.14 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  57.89 
 
 		 156 aa  166  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  58.55 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  58.55 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  58.55 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  58.55 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  58.55 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  58.55 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  58.55 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  59.21 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  57.89 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  54.19 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  53.95 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  44.81 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  48.82 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  41.25 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  47.18 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  43.11 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  43.64 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  41.61 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  50.82 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  49.26 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  46.04 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  41.77 
 
 		 175 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  44.44 
 
 		 446 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  51.3 
 
 		 156 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  44.93 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  41.89 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  43.54 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  40.14 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  41.48 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  38.26 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  40.14 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  45.9 
 
 		 156 aa  103  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  37.35 
 
 		 168 aa  103  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  35.67 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  41.8 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.82 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  35.33 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  41.33 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  35.33 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  35.33 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  38.17 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  44.35 
 
 		 301 aa  100  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  35.48 
 
 		 188 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.32 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  36.5 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  40.34 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  33.56 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  38.85 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  35.1 
 
 		 178 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  38 
 
 		 174 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  42.28 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  34 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  43.8 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  34.16 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  36.84 
 
 		 201 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  39.83 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  43.48 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  42.98 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  36.88 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  31.79 
 
 		 173 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  37.12 
 
 		 186 aa  94  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.1 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  42.37 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  41.32 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  31.65 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  36.13 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  35.71 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  37.88 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  40 
 
 		 182 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  35.61 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  37.4 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  37.01 
 
 		 160 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  38.28 
 
 		 183 aa  90.1  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  34.97 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  38.98 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.77 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  36.8 
 
 		 187 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  34.78 
 
 		 169 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  43.97 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  38.66 
 
 		 147 aa  87  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  37.72 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  41.38 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  39.13 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  39.66 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  39.66 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  35.71 
 
 		 176 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  36.59 
 
 		 195 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  34.31 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  36.13 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 182 aa  85.1  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  39.66 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  33.86 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  40.17 
 
 		 171 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>