More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0180 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  80.92 
 
 		 130 aa  222  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  58.26 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  52.29 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  42.75 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  45.39 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  52.29 
 
 		 163 aa  120  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  51.38 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  53.77 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  53.77 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  53.77 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  53.77 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  53.77 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  53.77 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  50.89 
 
 		 164 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  53.85 
 
 		 172 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  53.85 
 
 		 172 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  53.85 
 
 		 169 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  52.88 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  43.48 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  45.9 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  47.32 
 
 		 188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  45.22 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  44.54 
 
 		 169 aa  104  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  42.24 
 
 		 187 aa  104  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  48.18 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  48.18 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  48.18 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  47.17 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  47.17 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  48.18 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  48.18 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  39.23 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  46.36 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  46.36 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  37.59 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  45.19 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  37.4 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2171  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00228216  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2133  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000570292  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  37.58 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  40.16 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  40.16 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  33.81 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  38.35 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  34.03 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  37.32 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  45.28 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  34.42 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  45.28 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  45.19 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  38.24 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  33.09 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  44.34 
 
 		 178 aa  84  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  41.59 
 
 		 168 aa  84  7e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  37.82 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  39.47 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  39.47 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  33.1 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  36.43 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  39.44 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  43.69 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  43.69 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  36.03 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  34.53 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  34.06 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>