71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3200 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  53.71 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  51.38 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  52.97 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  56.06 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  50 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  50.95 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  51.47 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  48.31 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  50.51 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  50.51 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  50.51 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  48.76 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  47.44 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  49.48 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  47.17 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  48.58 
 
 		 449 aa  188  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  46.31 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  42.06 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  39.62 
 
 		 532 aa  165  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  41.59 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  43.98 
 
 		 251 aa  161  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  44.04 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  38.14 
 
 		 453 aa  155  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  45.77 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  40.64 
 
 		 347 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  39.81 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  43.01 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  40.09 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  42.49 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  37.24 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  36.45 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  35.71 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  34.31 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  31.9 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  33.17 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  28.43 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  42.47 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  29.61 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  29.18 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  31.5 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  30.81 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  30.37 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  32.12 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  30.4 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  27.81 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  30.94 
 
 		 340 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  26.37 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  30.29 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  27.72 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  29.25 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  29.7 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  30.07 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  29.32 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  30.81 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  29.7 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  29.17 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  30.33 
 
 		 319 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  29.15 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  29.61 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  29.03 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  30.85 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  27.32 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  30 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22620  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  27.75 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  29.85 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  29.85 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  27.42 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>