More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1889 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  100 
 
 		 347 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  42.17 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  38.32 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  41.44 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  41.56 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  41.58 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  40.49 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  40.48 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.97 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  40.4 
 
 		 322 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  39.48 
 
 		 317 aa  185  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  40.89 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  40.66 
 
 		 306 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  36.98 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  37.18 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 346 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  38.05 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 343 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  37.57 
 
 		 341 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.51 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  38.51 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.39 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  39.09 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.55 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  38.05 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  39.16 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.06 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.19 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  38.67 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.06 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 311 aa  179  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 311 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 		 331 aa  179  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  38.78 
 
 		 312 aa  179  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.71 
 
 		 311 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0914  monosaccharide-transporting ATPase  40.84 
 
 		 336 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  38.48 
 
 		 337 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 320 aa  175  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  39.6 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  39.31 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  38.08 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  38.92 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  40.61 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  37.58 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  41.12 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  38.13 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.28 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.28 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  35.6 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  41.77 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.58 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  40.58 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  38.12 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  40.58 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.98 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  39.47 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  35.94 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.75 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.96 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.01 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  35.94 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  35.94 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2687  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.01 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  37.95 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  37.31 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  38.33 
 
 		 322 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 335 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.99 
 
 		 350 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>