289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1662 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  303  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  44.03 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  45.22 
 
 		 177 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  49.68 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  44.59 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  45.86 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  45.86 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  45.86 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  45.86 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  45.86 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  44.23 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  45.86 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  45.22 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  45.86 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  45.86 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  35.67 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  43.95 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  40.37 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  47.77 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  38.85 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  38.85 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  35.67 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  38.99 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  37.58 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  44.59 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  47.17 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  41.67 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  41.29 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  40.38 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  41.51 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  42.04 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  41.18 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  39.1 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  41.94 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  37.11 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  40.38 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  39.74 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  43.23 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  37.89 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  32.67 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  40.38 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  36.97 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  34.81 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  34.81 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  48.08 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  39.24 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  43.4 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  37.89 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  41.45 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  46.45 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  38.51 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  47.44 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  37.89 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000535521  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000256643  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  31.41 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  31.85 
 
 		 154 aa  90.9  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  47.44 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  38.51 
 
 		 156 aa  90.5  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004221  hypothetical protein  37.16 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000988168  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000116859  decreased coverage  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  35.33 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000354968  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000490967  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000336055  unclonable  0.0000000000393257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000270066  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2868  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000163704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>